Mayotte, île française de l'archipel des Comores, dans l'océan Indien, proche de Madagascar, dispose d'une très grande valeur écologique irremplaçable à bien des égards. Le système récifo-lagonaire de Mayotte comprend, depuis la plage, vers la haute mer : Un lagon (1 100 km2), dont la profondeur varie entre 35 et 40 m pour atteindre localement 80 m. Il est caractérisé par des fonds sédimentaires sablo-vaseux, plats ou accidentés de « récifs de lagon ». Des récifs frangeants (76 km2) qui entourent l'ensemble de l'île et des îlots. Ces récifs représentent 160 km de linéaire. De 50 à 800 m de large, ils sont généralement recouverts d'accumulations détritiques et en partie envasés, selon l'importance des apports terrigènes arrivant des bassins versants. Un récif barrière (211 km2) large de 800 m à 1,5 km, qui ceinture le lagon et se révèle d'une continuité remarquable sur certains secteurs (nord-est et sud). Il est entrecoupé de passes nombreuses et étroites (12 passes) et présente des zones submergées à des profondeurs variables. Une double barrière interne (5 km2) discontinue au sud-ouest, à la structure géomorphologique exceptionnelle au niveau mondial, qui s'étend sur 18 km. Sa formation serait due à une subsidence en deux phases.